МИГРИРУЮЩИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ЭЛЕМЕНТЫ
(мобильные гены, прыгающие гены), дискретные фрагменты
(сегменты) ДНК, способные встраиваться в разные участки генома; их расположение
на хромосомах может меняться как в процессе историч. развития мира организмов,
так и в пределах жизни одного индивидуума. Найдены практически во всех изученных
организмах - от бактерий до человека. Они весьма разнятся по своему нуклеотидному
составу и той роли, к-рую они играют в клетке.
У прокариот (бактерии и
синезеленые водоросли) выделено неск. осн. групп М.г. э.-IS- и Tn-элементы,
эписомы, а также нек-рые бактериофаги, или фаги (вирусы бактерий, способные
ее поражать, репродуцироваться в ней и вызывать ее гибель). IS-элементы-простые
вставочные (ин-серционные) последовательности (обозначаются - в зависимости
от их нуклеотидного состава номерами IS1, IS2 и т.д.); содержат от 700 до 1500
пар нуклеотидов. Эти сегменты ДНК имеют инвертир. повторы на концах, содержащие
обычно неск. десятков нуклеотидных пар, и не содержат никаких генов, кроме тех,
к-рые необходимы для их перемещения (транспозиции) по геному. Они встречаются
в нек-рых плазмидах (внехромосомные носители наследственности) и умеренных
фагах (способны существовать в клетке в форме профага). Так, у разных штаммов
бактерии Escherichia coli (E. coli) присутствует в геноме 19 копий IS1-элементов.
Большинство др. IS-элементов также представлено в хромосомах разных штаммов
E. coli мн. копиями: IS2-от 0 до 12,IS3-от 4 до 6, IS4-от 1 до 2, IS5-от 0 до
10.
Транспозиции IS-элементов
не сопряжены с их исключением из мест исходной локализации в плазмидах или хромосоме;
при транспозиции IS-элемент удваивается и одна его копия остается на прежнем
месте, а другая попадает в новый локус (местоположение гена в хромосоме или
плазмиде). Таким образом транспозиции этого элемента сопряжены с репликацией
(удвоением) его ДНК.
Обычно IS-элементы встраиваются
(интегрируют) в разл. места бактериального генома, однако нек-рые участки оказываются
более предпочтительными, чем другие. Встраивание и исключение этих элементов
происходит с высокой точностью, что свидетельствует об участии в этих процессах
ферментов, узнающих инвертир. концевые повторы IS-элементов.
Ферментные системы, обусловливающие
транспозиции IS-элементов, по крайней мере, частично кодируются их собств. ДНК.
Так, IS1, судя пo длине его нуклеотидной последовательности, может кодировать
лишь небольшие полипептиды, к-рые участвуют в его транспозиции, вероятно, в
комплексе с клеточными белками.
Значение IS-элементов для
эволюции бактерий связано с тем, что эти элементы при своих перемещениях инакти-вируют
разл. гены или нарушают их нормальную регуляцию. Помимо прямого влияния на экспрессию
гена (раз-вития признака, контролируемого данным геном) вследствие транспозиции
инсерционной последовательности непосредственно в кодирующую часть гена или
его регулятор-ную зону, эти М. г. э. могут влиять также на транскрипцию (биосинтез
информационной РНК на матрице ДНК) окружающих их последовательностей ДНК генома.
Это происходит вследствие того, что мн. IS-элементы содержат промоторные (инициирующие
транскрипцию) и термина-торные (прекращающие транскрипцию) участки ДНК. Транспозиции
IS-элементов могут вызывать слияние двух не связанных
ранее генов или оперонов (совокупность связанных между собой генов и прилегающих
к ним регуляторных участков) с образованием новых функцион. единиц, а также
индуцировать все виды хромосомных перестроек (см. Мутации). Соединение
разнородных репликонов (элементарная генетич. структура, способная к самокопированию)
имеет большое биол. значение, т. к. объединяет ранее разобщенные генетич. детерминанты,
подчас принадлежащие разным видам организмов.
Tn-элементы (сложные перемещающиеся
элементы, или транспозоны) принципиально отличаются от IS-элементов только тем,
что содержат дополнит. структурные гены, не имеющие отношения к ф-ции транспозиции.
Известно много транспозонов, в состав к-рых входят гены устойчивости к антибиотикам,
тяжелым металлам и др. ядам. При этом один и тот же транспозон иногда несет
целый набор Детерминант резистентности (т. наз. V-детерминанты). Такие транспозоны
наиб. широко распространены, т.к. представляют ценность для селекции бактерий.
Существуют транспозоны, содержащие гены, к-рые кодируют токсины, а также свойственные
данному организму ферменты. Как правило, Tn-элементы несут на концах
целые или частично измененные IS-элементы, к-рые сообщают им способность перемещаться
по геному и вызывать в нем те же изменения, что и своб. IS-элементы. При этом
2 концевые IS-подобные терминальные последовательности в зависимости от типа
транспозона могут иметь прямую или инвертир. последовательность нуклеотидов.
Разные транспозоны часто содержат одинаковые терминальные последовательности
нуклеотидов.
Транспозоны вместе с плазмидами
и фагами (в к-рые они легко интегрируются) способны осуществлять обмен разл.
заключенных в них генов между весьма отдаленными видами бактерий, поэтому они
играют чрезвычайно важную роль в эволюции бактерий, включая адаптацию их к лек.
в-вам и продуцирования ими новых токсинов.
Транспозиция Tn-элементов
осуществляется по такому же механизму, как и IS-элементов, и также включает
стадию трансляции. Большинство транспозонов не выбирает для своего включения
строго определенные последовательности в ДНК. Однако обычно они предпочитают
нек-рые районы хромосом и даже специфич. участки, причем разные Тn-эле-менты
различаются по специфичности выбора мест интеграции.
Частота и характер перемещений
IS- и Тn-элементов варьируют в весьма широких пределах и зависят прежде всего
от св-в самих элементов. Напр., ТnЗ плазмиды перемещаются чаще в др. плазмиды,
чем в хромосому. На транспозиции влияют не только генетич., но и разл. внеш.
факторы, напр. УФ облучение. По-видимому, яды, инактивация к-рых обусловлена
генами транспозонов, могут индуцировать синтез ферментов, необходимых для транспозиции
этих транспозонов.
Др. группу М.г. э. бактерий
составляют эписомы-сложные плазмиды, способные к интеграции в хромосому. Эписомы,
как правило, содержат IS- или Tn-элементы, и в большинстве случаев именно благодаря
им они могут включаться в состав хромосомы. Так, в половой F-эписоме E. coli
(мол. м. 6.107) имеется одна копия IS2, две копии IS3
и одна копия Тn1000.
К М.г.э. прокариот относят
также умеренные фаги. l-Фаги (лямбдоидные фаги) обычно встраиваются в одно место
хромосомы, но при определенных условиях могут располагаться и в др. участках
генома. m-Фаги способны включаться в любые места бактериальной хромосомы, а
также в ДНК мн. др. фагов и плазмид. Интеграция лямбдо-идных фагов обеспечивается
ферментной системой, состоящей из клеточных белков и белков, кодируемых геномом
фага.
m-Фаг во мн. отношениях
сходен с IS- и Tn-элементами и отличается от них только тем, что может формировать
вирусные частицы. Предполагают, что IS- и Тn-элементы произошли из фага типа
ц в результате утери большинства его генов.
Умеренные фаги способны
вносить существ. изменения в структуру и функционирование бактериального генома
благодаря двум процессам - интеграции фаговой ДНК в хромосому бактерии и трансдукции
(переносу фагом бактериальных генов из одних клеток в другие). Трансдуцирую-щие
фаги образуются в результате неточного исключения из хромосомы интегрир. фаговой
ДНК. При этом часть собственной ДНК фага утрачивается, и вместо нее в фаговый
геном включается участок бактериальной ДНК, достигающий иногда значит. размеров.
Интегрир. фаги могут мутировать и терять способность к исключению из хромосомы,
становясь вследствие этого ее неотъемлемой частью. В этом случае гены фага начинают
определять ф-ции клетки, т.е. становятся ее собств. генами.
У эукариот (все организмы,
за исключением бактерий и синезеленых водорослей) также широко распространены
М.г. э., к-рые аналогичны М.г. э. прокариот по общему плану строения, способу
транспозиции и генетич. эффекту. Элементы, подобные IS и транспозонам, найдены
у мн. эукариот (грибы, растения, млекопитающие и др.). Разл. эписомоподобные
факторы обнаружены в ядре и цитоплазме дрожжей. Умеренным фагам бактерий соответствуют
онкогенные вирусы, в частности РНК-содержащие вирусы (ретровирусы) позвоночных.
В геномах низших эукариот
обнаружены М.г.э. разных типов, среди к-рых лучше всего изучена т. наз. последовательность
Tyl дрожжей. Этот элемент представлен в геноме 4-35 копиями, локализация к-рых
отличается у разных штаммов. Tyl содержит 5,6 тыс. пар нуклеотидов и ограничен
прямыми повторами, содержащими ок. 300 пар нуклеотидов (т. наз. 5-последовательности).
Копии Tyl не полностью идентичны друг другу и составляют таким образом гетерог.
семейство. В том случае, если две копии Tyl заключают между собой клеточные
гены, они перемещают их по генoму, т. е. образуют истинные транспозоны. Включение
Tyl-подобных элементов в регуляторные зоны генов может вызывать не только инактивацию
локусов, но и изменения механизма их регуляции, что, по-видимому, связано с
присутствием в нуклеотидной последовательности Tyl специфич. участков узнавания
регуляторных белков.
Важным отличием М. г. э.
эукариот от таковых у бактерий является их способность при включении в тот или
иной локус изменять св-ва ферментов (продуктов генов-мишеней), а не только прерывать
их синтез.
В геноме дрозофилы, а также
др. животных, включая млекопитающих, обнаружен целый ряд семейств подвижных
генетич. элементов, к-рые, как предполагают, подобно транспозонам бактерий,
меняют свою локализацию, не покидая хромосом. Примером могут служить FB-элементы,
или палиндромы-сегменты ДНК, ограниченные длинными инвертер. повторами; протяженность
последних варьирует в широких пределах-от 0,2 тыс. до 1,3 тыс. пар нуклеотидов.
Участок, заключенный между инвертир. повторами и условно называемый петлей,
не является обязательной составной частью FB-элемента. Возможно, что в нек-рых
случаях он соответствует участку генома, захваченному этим элементом при транспозиции.
Наиб. изучена мол. организация
т.наз. мобильных дис-пергир. генов (МДГ) дрозофилы, построенных также по типу
транспозонов. Известно неск. семейств МДГ. Все они имеют много общих св-в; это
множественные видоспеци-фичные активно транскрибируемые гены, локализация к-рых
на хромосомах варьирует не только у разных линий дрозофилы, но даже у разных
особей одной линии. Все они содержат 5-7 тыс. пар нуклеотидев и повторяются
в геноме от 10 до 200 раз. Отличит. особенность МДГ-присутствие на их концах
повторяющихся нуклеотидных последовательностей (250-500 пар), имеющих прямую
ориентацию. Считается, что МДГ способны перемещаться в результате синтеза РНК-копии
и последующей ее обратной транскрипции
в ДНК, к-рая замыкается в кольцо, после чего снова интегрируется в клеточный
геном.
Мобильными элементами генома
эукариот являются также проретровирусы (интегрированные в геном ретровирусы),
транспозиция к-рых, вероятно, осуществляется по такому же механизму, как и у
МДГ. Не исключено, что последние и проретровирусы являются генетич. элементами
одной природы.
Роль МДГ в экспрессии прилежащих
к ним генов, в мутагенезе и в общей эволюции эукариотич. генома м. б. весьма
значительной. МДГ-подобные элементы могут включаться в геном вирусов, а с ними,
вероятно, переноситься между организмами одного или разных видов.
Обычно транспозиции МДГ
происходят чрезвычайно редко. Однако они могут в определенных условиях учащаться.
Известны т. наз. транспозиц. взрывы, ведущие к одновременным перемещениям целого
ряда разных мобильных элементов.
Поскольку в составе многих
МДГ присутствуют промоторы транскрипции, а также особые последовательности-усилители,
обладающие способностью повышать эффективность транскрипции с участием др. промоторов,
внедрение МДГ может активно влиять на деятельность всего генного окружения.
Возможно, активация определенных генов иногда оказывается полезной для организма.
В то же время внедрение рядом с протоонкогенами МДГ может вести к онкогенной
трансформации клетки. Предполагают, что в опухолевых клетках происходит активация
процессов транспозиции нек-рых типов М.г.э., что ускоряет микроэволюцию опухолевых
клеток и способствует развитию опухолей.
М. г. э. открыты в 40-х
гг. 20 в. Б. Мак-Клинток на основании генетич. анализа нестабильных мутаций
у кукурузы. Исследование их мол. природы начато в 60-х гг. в связи с обнаружением
нового типа мутационных изменений у бактерий (т.наз. вставочных мутаций) и идентификацией
носителей этих мутаций. Структурно-функцион. исследования М. г. э. эукариот
на мол. уровне ведутся с кон. 70-х гг. с использованием методов клонирования
(получение наследственно однородных поколений особи или клетки путем бесполого
размножения) и генетич. инженерии.
Лит.: Хесин Р. Б.,
Непостоянство генома, М., 1984; Mobile genetic elements, ed. by J.A. Shapiro,
N.Y., 1983. П.Л. Иванов.
|